Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC85BQ15834 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC85BQ15834 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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