Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NECTIN1Q15223 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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