Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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