Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCINQ13939 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCINQ13939 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCINQ13939 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCINQ13939 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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