Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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