Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAPSNQ13702 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms