Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NAE1Q13564 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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