Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUBB3Q13509 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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TUBB3Q13509 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUBB3Q13509 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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