Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIGQ13278 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIGQ13278 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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