Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NME3Q13232 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NME3Q13232 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NME3Q13232 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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NME3Q13232 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NME3Q13232 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NME3Q13232 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME3Q13232 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME3Q13232 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME3Q13232 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME3Q13232 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NME3Q13232 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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