Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFX1Q12986 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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