Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GRIN2AQ12879 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
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