Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SREBF2Q12772 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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