Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 YNL205CYNL205C 423 nt2.81□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.81□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 RTC6YPL183W-A 282 nt2.81□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 IPT1YDR072C 1584 nt2.81□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 HDA3YPR179C 1968 nt2.81□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 NUP120YKL057C 3114 nt2.81□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 SNU114YKL173W 3027 nt2.8□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 TRM2YKR056W 1920 nt2.8□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 PCC1YKR095W-A 267 nt2.8□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 HEF3YNL014W 3135 nt2.8□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 STE23YLR389C 3084 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 RIX1YHR197W 2292 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 SDH6YDR379C-A 240 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 UPS1YLR193C 528 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 CSE2YNR010W 450 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 FUN30YAL019W 3396 nt2.79□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 GLC3YEL011W 2115 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 YJL135WYJL135W 318 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 LSM7YNL147W 348 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 BUD4YJR092W 4344 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 FLO9YAL063C 3969 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 MPH1YIR002C 2982 nt2.78□□□□□ -1.96
NPC2Q12408 PAN3YKL025C 2040 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 MDM20YOL076W 2391 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 PRE4YFR050C 801 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 OLI1Q0130 231 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YLR140WYLR140W 327 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 GRX8YLR364W 330 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YMR321CYMR321C 318 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 SAK1YER129W 3429 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 KAP95YLR347C 2586 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YKU70YMR284W 1809 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 BAS1YKR099W 2436 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 SGD1YLR336C 2700 nt2.77□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 SPO14YKR031C 5052 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YDL242WYDL242W 354 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YDR426CYDR426C 378 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 CHO2YGR157W 2610 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 TOF2YKR010C 2316 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 TOR1YJR066W 7413 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 ALK2YBL009W 2031 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 GUP1YGL084C 1683 nt2.76□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 ORC1YML065W 2745 nt2.75□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 LCD1YDR499W 2244 nt2.75□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YOR015WYOR015W 360 nt2.75□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 NUT2YPR168W 474 nt2.75□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 CHS2YBR038W 2892 nt2.75□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 NAB3YPL190C 2409 nt2.74□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 BCH1YMR237W 2175 nt2.74□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.74□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 RGM1YMR182C 636 nt2.74□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 FPR1YNL135C 345 nt2.74□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 AI2Q0055 2565 nt2.74□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 NMD2YHR077C 3270 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 RGC1YPR115W 3252 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 SMC2YFR031C 3513 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 HEH2YDR458C 1992 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 TMN3YER113C 2121 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 ERP6YGL002W 651 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YLR255CYLR255C 354 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 PSY2YNL201C 2577 nt2.73□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 DYN1YKR054C 12279 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 snR76snR76 109 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 snR85snR85 171 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 RRT15YLR162W-A 189 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 YML037CYML037C 1023 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 CSR2YPR030W 3366 nt2.72□□□□□ -1.97
NPC2Q12408 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 TRX1YLR043C 312 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 APC9YLR102C 798 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 COA4YLR218C 453 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 YBR224WYBR224W 516 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 VMA9YCL005W-A 222 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 ENA5YDR038C 3276 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 ENA2YDR039C 3276 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 ENA1YDR040C 3276 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 VPS35YJL154C 2835 nt2.71□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 YER039C-AYER039C-A 219 nt2.7□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 YLR012CYLR012C 300 nt2.7□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 PTC5YOR090C 1719 nt2.7□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 ROG1YGL144C 2058 nt2.7□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 PEX8YGR077C 1770 nt2.69□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 YAK1YJL141C 2424 nt2.69□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 UBP11YKR098C 2154 nt2.69□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 TOM1YDR457W 9807 nt2.69□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 CDC27YBL084C 2277 nt2.69□□□□□ -1.98
NPC2Q12408 SSS1YDR086C 243 nt2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.5 ms