Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 GRX8YLR364W 330 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 INP2YMR163C 2118 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 AHC1YOR023C 1701 nt3.47□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 GSC2YGR032W 5688 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 PWP2YCR057C 2772 nt3.46□□□□□ -1.85
TY1A-BLQ12266 CPA2YJR109C 3357 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YBR206WYBR206W 324 nt3.46□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 NCA2YPR155C 1851 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 SPT6YGR116W 4356 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 RSC1YGR056W 2787 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YGR050CYGR050C 357 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 NAB3YPL190C 2409 nt3.45□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 COG3YER157W 2406 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 TIM11YDR322C-A 291 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt3.44□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 GIS4YML006C 2325 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 SOM1YEL059C-A 225 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 VPH1YOR270C 2523 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 VPS53YJL029C 2469 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 SLM2YNL047C 1971 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YDL196WYDL196W 330 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 HYP2YEL034W 474 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YLR416CYLR416C 399 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 CDC31YOR257W 486 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 RPS23BYPR132W 438 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YCL046WYCL046W 324 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 HAL9YOL089C 3093 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 PUF4YGL014W 2667 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 FAT1YBR041W 2010 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 BCH1YMR237W 2175 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 HOS4YIL112W 3252 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YBR174CYBR174C 315 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 CIN1YOR349W 3045 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 LOS1YKL205W 3303 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 YCG1YDR325W 3108 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1A-BLQ12266 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 VID27YNL212W 2349 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 RSM19YNR037C 276 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 RTC6YPL183W-A 282 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 NOP4YPL043W 2058 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YBR225WYBR225W 2703 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 APC11YDL008W 498 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YDL118WYDL118W 381 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YPL044CYPL044C 549 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 VMA9YCL005W-A 222 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 USA1YML029W 2517 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 SGD1YLR336C 2700 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 STF2YGR008C 255 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 RAD26YJR035W 3258 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 MCM7YBR202W 2538 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YDL242WYDL242W 354 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YGL140CYGL140C 3660 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 RLI1YDR091C 1827 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 APE2YKL157W 2859 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 FIG4YNL325C 2640 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YLR352WYLR352W 2424 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 NOC3YLR002C 1992 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 HFM1YGL251C 3564 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YJL070CYJL070C 2667 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 BNI4YNL233W 2679 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 NUP159YIL115C 4383 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YOR019WYOR019W 2193 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 CTF4YPR135W 2784 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 YNL144CYNL144C 2223 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 OSH3YHR073W 2991 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 TAF6YGL112C 1551 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 VPS34YLR240W 2628 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 PEP3YLR148W 2757 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 TIM12YBR091C 330 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 RSN1YMR266W 2862 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 XRN1YGL173C 4587 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-BLQ12266 GIS1YDR096W 2685 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 PSO2YMR137C 1986 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 ARO80YDR421W 2853 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 YMR31YFR049W 372 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 POL1YNL102W 4407 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 APL5YPL195W 2799 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 EXO84YBR102C 2262 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 PHD1YKL043W 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 NOG1YPL093W 1944 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 YLR149CYLR149C 2193 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 SPO75YLL005C 2607 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 PRP22YER013W 3438 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 EMC1YCL045C 2283 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 ATG13YPR185W 2217 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 RPL31AYDL075W 342 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 YGR051CYGR051C 324 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 GRR1YJR090C 3456 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 SOK1YDR006C 2706 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1A-BLQ12266 PBY1YBR094W 2262 nt3.3□□□□□ -1.88
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