Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	YDR341C	YDR341C	1824 nt		1.63	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	HSL1	YKL101W	4557 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	TFC8	YPL007C	1767 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YDL062W	YDL062W	426 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	HNT1	YDL125C	477 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SPC1	YJR010C-A	285 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YMR230W-A	YMR230W-A	189 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YPL238C	YPL238C	390 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YBR174C	YBR174C	315 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YHR214C-C	YHR214C-C	1437 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YJR039W	YJR039W	3366 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	VPS52	YDR484W	1926 nt		1.62	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	DNF3	YMR162C	4971 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SYH1	YPL105C	2550 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YDL041W	YDL041W	354 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	RTR2	YDR066C	591 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	tT(UGU)Q1	tT(UGU)Q1	76 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SEC22	YLR268W	645 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SEN15	YMR059W	387 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SNC2	YOR327C	348 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SVS1	YPL163C	783 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	UBP1	YDL122W	2430 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	TBS1	YBR150C	3285 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SPR3	YGR059W	1539 nt		1.61	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	CRM1	YGR218W	3255 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SPC110	YDR356W	2835 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	MET32	YDR253C	576 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	CAJ1	YER048C	1176 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YGL069C	YGL069C	465 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	LSO2	YGR169C-A	279 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YBR071W	YBR071W	636 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	MEC1	YBR136W	7107 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	CDC27	YBL084C	2277 nt		1.6	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YOR019W	YOR019W	2193 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	PLC1	YPL268W	2610 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	YKL111C	YKL111C	336 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	TEN1	YLR010C	483 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	PKR1	YMR123W	369 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	COX7	YMR256C	183 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	SPC29	YPL124W	762 nt		1.59	□□□□□ -2.15
VIK1	Q12045	LYS9	YNR050C	1341 nt		1.59	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	MUD2	YKL074C	1584 nt		1.59	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	CFT1	YDR301W	4074 nt		1.58	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	POL5	YEL055C	3069 nt		1.58	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	GRR1	YJR090C	3456 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	CCH1	YGR217W	6120 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YCR087C-A	YCR087C-A	462 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	BTT1	YDR252W	450 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	SMB1	YER029C	591 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YER188C-A	YER188C-A	300 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	SPO24	YPR036W-A	204 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	NAM7	YMR080C	2916 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	KAR3	YPR141C	2190 nt		1.57	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	RPL9A	YGL147C	576 nt		1.56	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YAP3	YHL009C	993 nt		1.56	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	RIC1	YLR039C	3171 nt		1.56	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	ARP7	YPR034W	1434 nt		1.56	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YLR419W	YLR419W	4308 nt		1.56	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	CDC24	YAL041W	2565 nt		1.55	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	NOT5	YPR072W	1683 nt		1.55	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	ATP17	YDR377W	306 nt		1.55	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YOR146W	YOR146W	306 nt		1.55	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	CHS1	YNL192W	3396 nt		1.55	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	HIR3	YJR140C	4947 nt		1.55	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	snR79	snR79	84 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	APQ13	YJL075C	417 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	EAF6	YJR082C	342 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	GPI15	YNL038W	690 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	CYB5	YNL111C	363 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YBR224W	YBR224W	516 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	GPX2	YBR244W	489 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	SLM6	YBR266C	453 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	SHE9	YDR393W	1371 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	KCS1	YDR017C	3153 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YLR149C	YLR149C	2193 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YGR109W-B	YGR109W-B	4644 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	PET127	YOR017W	2403 nt		1.54	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	ATG11	YPR049C	3537 nt		1.53	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	YBL083C	YBL083C	426 nt		1.53	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	PET123	YOR158W	957 nt		1.53	□□□□□ -2.16
VIK1	Q12045	SGD1	YLR336C	2700 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	RBK1	YCR036W	1002 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	PAU3	YCR104W	375 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	RPL31A	YDL075W	342 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YER121W	YER121W	345 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	DDR48	YMR173W	1293 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	LOA1	YPR139C	903 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	MON2	YNL297C	4911 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	MSH6	YDR097C	3729 nt		1.52	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YBR012W-A	YBR012W-A	1323 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YOR142W-A	YOR142W-A	1323 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YPR158W-A	YPR158W-A	1323 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YGR290W	YGR290W	444 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YHR073W-A	YHR073W-A	177 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YOR248W	YOR248W	303 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	FYV8	YGR196C	2454 nt		1.51	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	PPN1	YDR452W	2025 nt		1.5	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	MMS22	YLR320W	4365 nt		1.5	□□□□□ -2.17
VIK1	Q12045	YGR045C	YGR045C	363 nt		1.5	□□□□□ -2.17

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