Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMOD3Q0VAK6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms