Protein–RNA interactions for Protein: Q07887

LDB18, Protein LDB18, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB18Q07887 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 NBL1YHR199C-A 222 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YLL020CYLL020C 306 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 FYV6YNL133C 522 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YOR376WYOR376W 369 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 RRP15YPR143W 753 nt0.7□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 RLM1YPL089C 2031 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YLR031WYLR031W 561 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 COX8YLR395C 237 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YLR458WYLR458W 381 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YNR068CYNR068C 819 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 PET20YPL159C 762 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 snR24snR24 89 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 CDC27YBL084C 2277 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 SHS1YDL225W 1656 nt0.69□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YCR016WYCR016W 873 nt0.68□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YJR003CYJR003C 1560 nt0.68□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YMR160WYMR160W 2451 nt0.68□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YOL118CYOL118C 309 nt0.68□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 ICS2YBR157C 768 nt0.68□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.67□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.67□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 NUP157YER105C 4176 nt0.66□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 NDD1YOR372C 1665 nt0.66□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 SMD2YLR275W 333 nt0.66□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 MGR1YCL044C 1254 nt0.66□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.65□□□□□ -2.3
LDB18Q07887 GSP1YLR293C 660 nt0.65□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YNL179CYNL179C 438 nt0.65□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YBL083CYBL083C 426 nt0.65□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 BI3Q0115 1554 nt0.65□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 ESA1YOR244W 1338 nt0.64□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 UTP20YBL004W 7482 nt0.64□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YAP3YHL009C 993 nt0.64□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 EMC5YIL027C 426 nt0.64□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 SFG1YOR315W 1041 nt0.64□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 CDC39YCR093W 6327 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 NOT5YPR072W 1683 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YEL010WYEL010W 351 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YOL024WYOL024W 519 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 ATP15YPL271W 189 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 RAD50YNL250W 3939 nt0.63□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YCR043CYCR043C 384 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 URM1YIL008W 300 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 HIT1YJR055W 495 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 PGA1YNL158W 597 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 IRC23YOR044W 474 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 RTC6YPL183W-A 282 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 SEC5YDR166C 2916 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 TSA2YDR453C 591 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 PPE1YHR075C 1203 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 RPC25YKL144C 639 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 HHT1YBR010W 411 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YPL034WYPL034W 498 nt0.61□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 UBC9YDL064W 474 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 SLU7YDR088C 1149 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 MZM1YDR493W 372 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YGL217CYGL217C 342 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YGR242WYGR242W 309 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 IMP3YHR148W 552 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 RPL40BYKR094C 387 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 TIM18YOR297C 579 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 PEX34YCL056C 435 nt0.6□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 SLX4YLR135W 2247 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 IST3YIR005W 447 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 BRX1YOL077C 876 nt0.59□□□□□ -2.31
LDB18Q07887 STB6YKL072W 2301 nt0.59□□□□□ -2.32
LDB18Q07887 BRO1YPL084W 2535 nt0.59□□□□□ -2.32
LDB18Q07887 YGL204CYGL204C 306 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB18Q07887 YIR020CYIR020C 303 nt0.58□□□□□ -2.32
LDB18Q07887 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt0.58□□□□□ -2.32
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