Protein–RNA interactions for Protein: Q07879

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, yeastyeast

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG10Q07879 RLM1YPL089C 2031 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 YDL009CYDL009C 324 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 RMD6YEL072W 696 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 FSH1YHR049W 732 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 YNL226WYNL226W 411 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 YOR152CYOR152C 771 nt0.91□□□□□ -2.26
ATG10Q07879 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PHS1YJL097W 654 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 VPS55YJR044C 423 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PGA1YNL158W 597 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YBL083CYBL083C 426 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 ATP15YPL271W 189 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 SAC3YDR159W 3906 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 AZF1YOR113W 2745 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 NOT5YPR072W 1683 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 MSS11YMR164C 2277 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 DGR2YKL121W 2559 nt0.9□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 BEM2YER155C 6504 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 MVP1YMR004W 1536 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 MMS22YLR320W 4365 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YNL114CYNL114C 372 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YNR068CYNR068C 819 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YOR105WYOR105W 327 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 RTC6YPL183W-A 282 nt0.89□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YCR043CYCR043C 384 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 GEP7YGL057C 864 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 RAD6YGL058W 519 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 RPC25YKL144C 639 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YLR149CYLR149C 2193 nt0.88□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 CLU1YMR012W 3834 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PAU2YEL049W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 OST5YGL226C-A 261 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 VOA1YGR106C 798 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PAU12YGR294W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PEP8YJL053W 1140 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PAU18YLL064C 363 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PAU6YNR076W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PHO80YOL001W 882 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 ERP4YOR016C 624 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 OST2YOR103C 393 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 PAU24YBR301W 363 nt0.87□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 NUP188YML103C 4968 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YOR376WYOR376W 369 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YPR063CYPR063C 423 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 GPX2YBR244W 489 nt0.86□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YGL042CYGL042C 306 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 BET4YJL031C 984 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YJL086CYJL086C 369 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YJR003CYJR003C 1560 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 VPS63YLR261C 327 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 MGE1YOR232W 687 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YPR146CYPR146C 330 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 SUS1YBR111W-A 291 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 MSN5YDR335W 3675 nt0.85□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 UFD2YDL190C 2886 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 SNF5YBR289W 2718 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 VPS74YDR372C 1038 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 RSM18YER050C 417 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YJL119CYJL119C 324 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 ROX1YPR065W 1107 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 YBR224WYBR224W 516 nt0.84□□□□□ -2.27
ATG10Q07879 SCC2YDR180W 4482 nt0.84□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YDR248CYDR248C 582 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 QCR9YGR183C 201 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 GIM5YML094W 492 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 CTK3YML112W 891 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 SMY1YKL079W 1971 nt0.83□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 IPI3YNL182C 1668 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YDL211CYDL211C 1119 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 RPL29YFR032C-A 180 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 HHT1YBR010W 411 nt0.82□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 DOP1YDR141C 5097 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 SEC5YDR166C 2916 nt0.81□□□□□ -2.28
ATG10Q07879 YLL020CYLL020C 306 nt0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.2 ms