Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TNP2Q05952 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms