Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 FYV12YOR183W 390 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YOR392WYOR392W 444 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 MGM1YOR211C 2646 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SPP41YDR464W 4308 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 BUD2YKL092C 3315 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 FKS1YLR342W 5631 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 VAR1Q0140 1197 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 ECL1YGR146C 636 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YML108WYML108W 318 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SEN15YMR059W 387 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 NEO1YIL048W 3456 nt2.22□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 HER1YOR227W 3741 nt2.21□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 VPS35YJL154C 2835 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 CDC60YPL160W 3273 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 TRM3YDL112W 4311 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 NUP192YJL039C 5052 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YER084W-AYER084W-A 513 nt2.21□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YLR053CYLR053C 327 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 TOM22YNL131W 459 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 SNC2YOR327C 348 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 snR41snR41 95 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 SLM6YBR266C 453 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 RIC1YLR039C 3171 nt2.2□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 SET2YJL168C 2202 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 PPN1YDR452W 2025 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YHL037CYHL037C 402 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YBL012CYBL012C 402 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 snR54snR54 86 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 COS111YBR203W 2775 nt2.19□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 CTF4YPR135W 2784 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 HOP2YGL033W 657 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YJR079WYJR079W 330 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 TEN1YLR010C 483 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 MUD2YKL074C 1584 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 ATG9YDL149W 2994 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 DCP2YNL118C 2913 nt2.18□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 TOR2YKL203C 7425 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 RPC10YHR143W-A 213 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YJR157WYJR157W 363 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 AIM29YKR074W 468 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 IRC19YLL033W 693 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YNL324WYNL324W 396 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 RTC6YPL183W-A 282 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 TSC3YBR058C-A 243 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 LYS9YNR050C 1341 nt2.17□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YHR125WYHR125W 306 nt2.16□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YKL063CYKL063C 504 nt2.16□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YMR324CYMR324C 243 nt2.16□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 RUF22RUF22 515 nt2.16□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 CDC27YBL084C 2277 nt2.16□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 RNH70YGR276C 1662 nt2.15□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 SYH1YPL105C 2550 nt2.15□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 CAT2YML042W 2013 nt2.15□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 VPS52YDR484W 1926 nt2.15□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YDR341CYDR341C 1824 nt2.15□□□□□ -2.06
SYF1Q04048 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.15□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 SEC22YLR268W 645 nt2.15□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.15□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 IRC10YOL015W 1761 nt2.15□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 RPL37BYDR500C 267 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 IES5YER092W 378 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YLR269CYLR269C 351 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YOR248WYOR248W 303 nt2.14□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 SWT1YOR166C 1377 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YDL041WYDL041W 354 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 NBL1YHR199C-A 222 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YAR068WYAR068W 486 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 GPX2YBR244W 489 nt2.13□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 SGD1YLR336C 2700 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 SBE22YHR103W 2559 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 PDR8YLR266C 2106 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 SCH9YHR205W 2475 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 USO1YDL058W 5373 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YGL069CYGL069C 465 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YGR042WYGR042W 816 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YKL202WYKL202W 582 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 STB4YMR019W 2850 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 RPH1YER169W 2391 nt2.12□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 NAM7YMR080C 2916 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 GDS1YOR355W 1569 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 SAC3YDR159W 3906 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 YDL062WYDL062W 426 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 LSO2YGR169C-A 279 nt2.11□□□□□ -2.07
SYF1Q04048 RRF1YHR038W 693 nt2.11□□□□□ -2.07
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