Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSBP2P81877 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms