Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX1P78337 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX1P78337 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITX1P78337 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITX1P78337 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX1P78337 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX1P78337 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms