Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CASP7P55210 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CASP7P55210 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP7P55210 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP7P55210 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP7P55210 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP7P55210 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms