Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA1P52294 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA1P52294 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KPNA1P52294 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KPNA1P52294 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA1P52294 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KPNA1P52294 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KPNA1P52294 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms