Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRCA2P51587 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRCA2P51587 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms