Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms