Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPHP41219 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRPHP41219 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPHP41219 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPHP41219 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPHP41219 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms