Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CEACAM3P40198 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM3P40198 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM3P40198 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM3P40198 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CEACAM3P40198 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms