Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 SFM1YOR021C 642 nt0.48□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YIL141WYIL141W 390 nt0.47□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 RRT16YNL105W 429 nt0.47□□□□□ -2.33
YRF1-2P40105 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 SLY1YDR189W 2001 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 MVB12YGR206W 306 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YHR212CYHR212C 336 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YAR060CYAR060C 336 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 TEX1YNL253W 1269 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 MGR1YCL044C 1254 nt0.46□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 RIM20YOR275C 1986 nt0.45□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 RGI1YER067W 486 nt0.45□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt0.45□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 MIX23YBL107C 591 nt0.45□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt0.45□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 AHC2YCR082W 387 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YIP1YGR172C 747 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 NOP10YHR072W-A 177 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YLR225CYLR225C 1224 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 RPL38YLR325C 237 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 LSM7YNL147W 348 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 SPP381YBR152W 876 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 SEC5YDR166C 2916 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 FUS2YMR232W 2034 nt0.44□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 RPI1YIL119C 1224 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 HYR1YIR037W 492 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 NUP188YML103C 4968 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 BFA1YJR053W 1725 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 DAS1YJL149W 1992 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YPD1YDL235C 504 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YGR219WYGR219W 342 nt0.43□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YCR090CYCR090C 549 nt0.42□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YDL157CYDL157C 357 nt0.42□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 MSC6YOR354C 2079 nt0.42□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 COF1YLL050C 432 nt0.41□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YLR311CYLR311C 348 nt0.41□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 ECM25YJL201W 1800 nt0.41□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 STB6YKL072W 2301 nt0.4□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 FAR7YFR008W 666 nt0.4□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YMR178WYMR178W 825 nt0.4□□□□□ -2.34
YRF1-2P40105 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.4□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 FYV6YNL133C 522 nt0.4□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt0.39□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YLL007CYLL007C 1998 nt0.39□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 UFE1YOR075W 1041 nt0.39□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 GRX7YBR014C 612 nt0.39□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 URB1YKL014C 5295 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 ESP1YGR098C 4893 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YJL049WYJL049W 1353 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 GIC1YHR061C 945 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YLR458WYLR458W 381 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YNL226WYNL226W 411 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 snR45snR45 172 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 LYS14YDR034C 2373 nt0.38□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 SMY1YKL079W 1971 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 ABM1YJR108W 372 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 RAD10YML095C 633 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 MFA2YNL145W 117 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YOR376WYOR376W 369 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 FMP23YBR047W 528 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 SLU7YDR088C 1149 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 AI5_BETAQ0075 1065 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 MEI4YER044C-A 1227 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 PRM8YGL053W 714 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 SAY1YGR263C 1275 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 RPL40BYKR094C 387 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 TIF11YMR260C 462 nt0.37□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 AIM9YER080W 1884 nt0.36□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.36□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 NIP100YPL174C 2607 nt0.36□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 SEC22YLR268W 645 nt0.36□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 ATX1YNL259C 222 nt0.36□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 YDR248CYDR248C 582 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 GIC2YDR309C 1152 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 TSA2YDR453C 591 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 HSK3YKL138C-A 210 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 IRC14YOR135C 342 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 AME1YBR211C 975 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 TRS20YBR254C 528 nt0.35□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 ENV11YGR071C 2583 nt0.34□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 SMB1YER029C 591 nt0.34□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 COX6YHR051W 447 nt0.34□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 TAP42YMR028W 1101 nt0.34□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 PEX34YCL056C 435 nt0.34□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 ARP9YMR033W 1404 nt0.34□□□□□ -2.35
YRF1-2P40105 NUT1YGL151W 3399 nt0.34□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 TAD1YGL243W 1203 nt0.33□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 SWS2YNL081C 432 nt0.33□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.33□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 NGG1YDR176W 2109 nt0.33□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 ECM12YHR021W-A 456 nt0.33□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 SDL1YIL167W 633 nt0.33□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 SLX4YLR135W 2247 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 GLG1YKR058W 1851 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 IRC19YLL033W 693 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YAR053WYAR053W 297 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.9 ms