Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SFTPDP35247 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms