Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OTX2P32243 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OTX2P32243 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OTX2P32243 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms