Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFNP31947 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFNP31947 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFNP31947 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFNP31947 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFNP31947 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFNP31947 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFNP31947 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFNP31947 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFNP31947 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFNP31947 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SFNP31947 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms