Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD34P28906 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD34P28906 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD34P28906 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD34P28906 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD34P28906 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD34P28906 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD34P28906 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD34P28906 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms