Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYT1P21579 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYT1P21579 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYT1P21579 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYT1P21579 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYT1P21579 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms