Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PF4V1P10720 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms