Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CYP3A4P08684 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms