Protein–RNA interactions for Protein: P08456

CHO1, CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHO1P08456 QCR7YDR529C 384 nt2.24□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YGL239CYGL239C 315 nt2.24□□□□□ -2.05
CHO1P08456 RPS27AYKL156W 249 nt2.24□□□□□ -2.05
CHO1P08456 RPL26AYLR344W 384 nt2.24□□□□□ -2.05
CHO1P08456 PRK1YIL095W 2433 nt2.24□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YNL018CYNL018C 1839 nt2.24□□□□□ -2.05
CHO1P08456 SWT1YOR166C 1377 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 SUL1YBR294W 2580 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 PTP3YER075C 2787 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 SNF5YBR289W 2718 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 AIM9YER080W 1884 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YDL152WYDL152W 366 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 RPS24AYER074W 408 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 TIM13YGR181W 318 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 ISF1YMR081C 1017 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 EDS1YBR033W 2760 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 AFI1YOR129C 2682 nt2.23□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 SMD1YGR074W 441 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YHL037CYHL037C 402 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 MAM33YIL070C 801 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 HSK3YKL138C-A 210 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 APC9YLR102C 798 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.22□□□□□ -2.05
CHO1P08456 RIC1YLR039C 3171 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 KRE33YNL132W 3171 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 SPF1YEL031W 3648 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 VPS35YJL154C 2835 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 WIP1YDR374W-A 270 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YDR413CYDR413C 576 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 KEL2YGR238C 2649 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 NOP10YHR072W-A 177 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YBL073WYBL073W 312 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 TIM18YOR297C 579 nt2.21□□□□□ -2.06
CHO1P08456 CRM1YGR218W 3255 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 SMY1YKL079W 1971 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 NHP2YDL208W 471 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YOR055WYOR055W 435 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YPL229WYPL229W 621 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 NUM1YDR150W 8247 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 MLH1YMR167W 2310 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 SGM1YJR134C 2124 nt2.2□□□□□ -2.06
CHO1P08456 SVL3YPL032C 2478 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 PHO2YDL106C 1680 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 CBF2YGR140W 2871 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YER181CYER181C 324 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 TWF1YGR080W 999 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 COX14YML129C 213 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YPR099CYPR099C 357 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YER138CYER138C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YER160CYER160C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YJR027WYJR027W 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YML039WYML039W 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YML045WYML045W 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YMR050CYMR050C 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.19□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YOL098CYOL098C 3114 nt2.18□□□□□ -2.06
CHO1P08456 HYP2YEL034W 474 nt2.18□□□□□ -2.06
CHO1P08456 SNC1YAL030W 354 nt2.18□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YMR320WYMR320W 306 nt2.18□□□□□ -2.06
CHO1P08456 VMA9YCL005W-A 222 nt2.18□□□□□ -2.06
CHO1P08456 DIS3YOL021C 3006 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YDR102CYDR102C 333 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 PSY1YKL076C 384 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 HCH1YNL281W 462 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 snR36snR36 182 nt2.17□□□□□ -2.06
CHO1P08456 NOT5YPR072W 1683 nt2.16□□□□□ -2.06
CHO1P08456 TOF2YKR010C 2316 nt2.16□□□□□ -2.06
CHO1P08456 RBK1YCR036W 1002 nt2.16□□□□□ -2.06
CHO1P08456 EMC6YLL014W 327 nt2.16□□□□□ -2.06
CHO1P08456 UBP15YMR304W 3693 nt2.16□□□□□ -2.06
CHO1P08456 BNR1YIL159W 4128 nt2.16□□□□□ -2.06
CHO1P08456 MNL2YLR057W 2550 nt2.15□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YBR184WYBR184W 1572 nt2.15□□□□□ -2.06
CHO1P08456 YBP1YBR216C 2025 nt2.15□□□□□ -2.06
CHO1P08456 TRS130YMR218C 3309 nt2.15□□□□□ -2.07
CHO1P08456 YER097WYER097W 330 nt2.15□□□□□ -2.07
CHO1P08456 YGL069CYGL069C 465 nt2.15□□□□□ -2.07
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