Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HSP90AB1P08238 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HSP90AB1P08238 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms