Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APOC1P02654 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC1P02654 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC1P02654 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms