Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IGKV1-17P01599 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms