Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MBD3O95983 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MBD3O95983 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD3O95983 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms