Protein–RNA interactions for Protein: O95935

TBX18, T-box transcription factor TBX18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX18O95935 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TBX18O95935 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TBX18O95935 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TBX18O95935 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms