Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
ABCC9O60706 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC40.83■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC40.82■■■■■ 4.13
ABCC9O60706 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ABCC9O60706 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms