Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZIC3O60481 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms