Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DHX16O60231 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DHX16O60231 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DHX16O60231 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DHX16O60231 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DHX16O60231 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DHX16O60231 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms