Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TIMM8AO60220 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TIMM8AO60220 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms