Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYTH3O43739 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CYTH3O43739 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms