Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF646O15015 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF646O15015 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF646O15015 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms