Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP17L21D6R901 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L21D6R901 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms